Le fonctionnement du CRIGE est financé par l'Etat, la Région et les Départements dans le cadre du contrat de projet 2007-2013. L'Etat et la Région prennent à leur charge 80% des 4,5 millions d'euros programmés ; les Départements se répartissent les 20% restants sur la base d'un ratio population/potentiel fiscal.

L'Etat, la Région et les Départements prennent également en charge l'acquisition des référentiels géographiques, avec le soutien de l'Europe et une participation des principaux EPCI pour les données à grande échelle. L'enveloppe CPER consacrée à l'acquisition de données s'élève à 5 millions d'euros.

Bien qu'ils ne soient pas sollicités financièrement, les organismes bénéficiaires des données et des services diffusés par le CRIGE sont tous des partenaires en puissance. Ils s'engagent en retour à participer activement au fonctionnement du réseau géomatique régional (pôles métiers, journées et ateliers techniques, veille, recettes, …). Les producteurs de données métiers sont invités à alimenter et participer au maintien du système d'information régional. Enfin, tous les partenaires du CRIGE ont la possibilité d'exprimer leurs besoins et attentes aux deux réunions annuelles du Comité technique consultatif.